有名どころ…しかし更新がもうされてない……

http://www.geocities.jp/marico3535/
ざ・ぱるす・ふぃくしょん
えんじょい
いわゆるループものでシンジがその長い時の中でおかしくなっています。
タイトル通りいかに自分がエンジョイした生をループの中で送れるかということを中心に、初号機といっしょに楽しもうとしています。
いきなりエヴァ初号機を奪い取り独立国を名乗るところから始まる飛んでも作品、しかし非常に面白いのでお勧め。
他作品もぜひ目を通してみてください。

http://un-nerv.org/FoA/
Under the "Flag of ASUKA"アスカの旗の下に
でら氏
雌伏と至福
使徒戦後、ただの中学生となってしまったシンジに利益がないと判断したネルフはシンジを一人放り出すことに、しかしシンジは力をつけて戻ってきたというお話。
でら氏の小説もそうですがこのサイト自体がアスカファンのサイトですので当然ヒロインはアスカ。
有能でカッコイイシンジをよく書かれる作者さんです。

櫂氏
碇シンジのホリディ・ナイト
アスカのためにかっこよくなり文武に励むシンジ、一方ガサツな部分をなくそうとバレエや言葉を直しシンジに勉強を教えたりするアスカ。
しかしそのあまのじゃくなところはなくならずくっつかないまま高校三年生になってしまう。そこで周囲が結託して二人をくっつけようと様々な画策を行っていくお話。
話の流れもよく読みやすいし、アスカも非常に可愛く魅力的に書かれています。

http://kaedesakura.hp.infoseek.co.jp/
〜楓桜　かすい亭〜
優しすぎるあなたに
いわゆる逆行もので現行のシンジと二人いる作品。
逆行シンジが兄となり歴史を変えようとする作品という意味ではありきたりですが文章が上手い、というか独特で優しい雰囲気を持っています。
サードインパクトなどのつらい経験をしたシンジが少しだけ優しく強くなっていることが原因なのか、この小説を読んでいると結末まで行ってないのにアスカもレイも幸せになりそうだと思えるから不思議。